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[CEO인사이트] 마이크로바이옴 시장 선점 경쟁…기업 간 전략 갈린다	2026-03-23 16:11
인체 장내 미생물 생태계를 활용한 마이크로바이옴이 차세대 바이오 산업의 핵심 분야로 부상하면서 글로벌 기업 간 선점 경쟁도 한층 치열해지고 있습니다. 단순히 질병을 억제하는 수준을 넘어, 장내 미생물 균형을 회복하고 면역 반응을 조절해 질환을 근본적으로 치료하려는 시도가 확산되며 새로운 치료 패러다임이 형성되고 있는 모습입니다. 특히 미국은 치료제 상용화에 주력하는 한편, 유럽은 면역항암제 개발 전략으로 마이크로바이옴 시장 주도권 확보에 나서고 있습니다. 여기에 기업들이 인공지능(AI)과 대규모 유전체 데이터를 결합한 연구 개발에도 속도를 내면서, 마이크로바이옴 산업은 정밀 의료와 데이터 기반 신약 개발을 이끄는 핵심 분야로 부상하고 있습니다. ◇미국, 마이크로바이옴 치료제 시장 주도권 쟁탈전 치열 미국 기업들은 장내 미생물 생태계를 복원해 질병을 치료하는 마이크로바이옴 치료제 개발에 주력하고 있습니다. 현재 이 분야의 선두주자는 미국 바이오기업 세레스 테라퓨틱스(Seres Therapeutics)입니다. 세레스 테라퓨틱스는 지난 2023년 경구용 마이크로바이옴 치료제 '보우스트(Vowst)'로 세계 최초로 미국식품의약국(FDA) 승인을 획득했습니다. 보우스트는 항생제 치료로 무너진 장내 미생물 생태계를 복원해 병원균 증식을 억제하는 방식으로, 특정 균을 사멸시키는 데 집중했던 기존 항생제 치료의 패러다임을 바꿨다는 평가를 받습니다. 세레스 테라퓨틱스의 강력한 대항마로는 미국의 베단타 바이오사이언스(Vedanta Biosciences)가 꼽힙니다. 베단타 바이오사이언스는 현재 차세대 파이프라인 'VE303'에 대한 글로벌 임상 3상 연구를 진행하며 시장 공략에 속도를 내는 모습입니다. 앞서 진행된 임상 2상에서 VE303은 고용량 투여군의 재발률을 위약군 대비 80% 이상 낮추는 효능을 입증했습니다. 업계는 VE303의 임상이 성공적으로 완료될 경우, 글로벌 마이크로바이옴 시장이 세레스 테라퓨틱스와 베단타 바이오사이언스의 양강 구도로 재편될 가능성이 높다고 보고 있습니다. ◇유럽, 마이크로바이옴 활용 면역항암제 개발 선도 유럽에서는 미생물을 '면역 유도제'로 활용해 암세포를 직접 공격하는 정밀 의료 체계 구축에 속도를 내는 모습입니다. 프랑스 기업 엔테롬(Enterome)은 장내 미생물 유래 항원을 이용해 체내 면역 반응을 강력하게 유도하는 '온코미믹스(OncoMimics)' 플랫폼을 통해 차세대 항암 치료 분야를 개척하고 있다는 평가를 받습니다. 엔테롬의 핵심 기술은 '모사(Mimicry)'로, 특정 장내 박테리아 단백질이 암세포 항원과 구조적으로 유사한 점을 이용한 전략을 말합니다. 즉, 우리 몸의 면역세포가 박테리아를 적군으로 인식해 공격할 때 암세포까지 종양으로 오인해 함께 타격하도록 유도하는 방식입니다. 업계는 엔테롬의 이러한 시도가 기존 면역항암제의 한계를 극복할 수 있는 혁신적 대안이 될 수 있을 것으로 기대하고 있습니다. 영국의 마이크로바이오티카(Microbiotica) 역시 마이크로바이옴 기반 면역항암제 개발에 집중하고 있습니다. 마이크로바이오티카는 암 환자의 장내 미생물 군집을 정밀 분석해, 면역항암제에 긍정적 반응을 보이는 환자에게 공통적으로 나타나는 특정 미생물 서명(Signature)을 찾아내는 연구에 주력하고 있는 것으로 알려졌습니다. ◇AI와 데이터로 진화하는 마이크로바이옴 의료 한편, 일부 선도 기업들은 단순히 유익균을 찾아내는 수준을 넘어, 인공지능(AI)과 데이터를 결합해 질병 치료 전략을 설계하는 데이터 플랫폼 기업으로 진화하고 있습니다. 대표적인 기업인 미국의 세컨드 게놈(Second Genome)은 자체 개발한 미생물 데이터베이스 'sg-4sight'를 바탕으로 대규모 유전체 데이터를 분석하고 있습니다. 특히 길리어드 사이언스(Gilead Sciences) 등 글로벌 빅파마와 협력하며 염증성 장질환(IBD) 및 간 질환 치료를 위한 신약 후보물질 도출에 속도를 내고 있습니다. AI 기술로 신약 후보 물질 발굴 기간을 획기적으로 단축하면서 마이크로바이옴 정밀 의료의 표준을 구축하고 있다는 평가가 나옵니다. 또 다른 혁신 기업인 캔버스 바이오사이언스(Kanvas Biosciences)는 AI 알고리즘을 활용해 미생물의 장내 위치를 실시간 시각화하는 기술을 선보였습니다. 이는 신약 개발 과정의 시행착오를 줄이고 임상 성공률을 높이는 핵심 기술로 평가되며, 향후 마이크로바이옴 시장의 판도를 바꿀 중요한 요인으로 주목받고 있습니다. [ 이기연 연구원 / lee.giyeon@mktv.co.kr ]

[CEO인사이트] 마이크로바이옴 시장 선점 경쟁…기업 간 전략 갈린다

2026-03-23 16:11

인체 장내 미생물 생태계를 활용한 마이크로바이옴이 차세대 바이오 산업의 핵심 분야로 부상하면서 글로벌 기업 간 선점 경쟁도 한층 치열해지고 있습니다.

단순히 질병을 억제하는 수준을 넘어, 장내 미생물 균형을 회복하고 면역 반응을 조절해 질환을 근본적으로 치료하려는 시도가 확산되며 새로운 치료 패러다임이 형성되고 있는 모습입니다.

특히 미국은 치료제 상용화에 주력하는 한편, 유럽은 면역항암제 개발 전략으로 마이크로바이옴 시장 주도권 확보에 나서고 있습니다.

여기에 기업들이 인공지능(AI)과 대규모 유전체 데이터를 결합한 연구 개발에도 속도를 내면서, 마이크로바이옴 산업은 정밀 의료와 데이터 기반 신약 개발을 이끄는 핵심 분야로 부상하고 있습니다.

◇미국, 마이크로바이옴 치료제 시장 주도권 쟁탈전 치열

미국 기업들은 장내 미생물 생태계를 복원해 질병을 치료하는 마이크로바이옴 치료제 개발에 주력하고 있습니다.

현재 이 분야의 선두주자는 미국 바이오기업 세레스 테라퓨틱스(Seres Therapeutics)입니다.

세레스 테라퓨틱스는 지난 2023년 경구용 마이크로바이옴 치료제 '보우스트(Vowst)'로 세계 최초로 미국식품의약국(FDA) 승인을 획득했습니다.

보우스트는 항생제 치료로 무너진 장내 미생물 생태계를 복원해 병원균 증식을 억제하는 방식으로, 특정 균을 사멸시키는 데 집중했던 기존 항생제 치료의 패러다임을 바꿨다는 평가를 받습니다.

세레스 테라퓨틱스의 강력한 대항마로는 미국의 베단타 바이오사이언스(Vedanta Biosciences)가 꼽힙니다.

베단타 바이오사이언스는 현재 차세대 파이프라인 'VE303'에 대한 글로벌 임상 3상 연구를 진행하며 시장 공략에 속도를 내는 모습입니다.

앞서 진행된 임상 2상에서 VE303은 고용량 투여군의 재발률을 위약군 대비 80% 이상 낮추는 효능을 입증했습니다.

업계는 VE303의 임상이 성공적으로 완료될 경우, 글로벌 마이크로바이옴 시장이 세레스 테라퓨틱스와 베단타 바이오사이언스의 양강 구도로 재편될 가능성이 높다고 보고 있습니다.

◇유럽, 마이크로바이옴 활용 면역항암제 개발 선도

유럽에서는 미생물을 '면역 유도제'로 활용해 암세포를 직접 공격하는 정밀 의료 체계 구축에 속도를 내는 모습입니다.

프랑스 기업 엔테롬(Enterome)은 장내 미생물 유래 항원을 이용해 체내 면역 반응을 강력하게 유도하는 '온코미믹스(OncoMimics)' 플랫폼을 통해 차세대 항암 치료 분야를 개척하고 있다는 평가를 받습니다.

엔테롬의 핵심 기술은 '모사(Mimicry)'로, 특정 장내 박테리아 단백질이 암세포 항원과 구조적으로 유사한 점을 이용한 전략을 말합니다.

즉, 우리 몸의 면역세포가 박테리아를 적군으로 인식해 공격할 때 암세포까지 종양으로 오인해 함께 타격하도록 유도하는 방식입니다.

업계는 엔테롬의 이러한 시도가 기존 면역항암제의 한계를 극복할 수 있는 혁신적 대안이 될 수 있을 것으로 기대하고 있습니다.

영국의 마이크로바이오티카(Microbiotica) 역시 마이크로바이옴 기반 면역항암제 개발에 집중하고 있습니다.

마이크로바이오티카는 암 환자의 장내 미생물 군집을 정밀 분석해, 면역항암제에 긍정적 반응을 보이는 환자에게 공통적으로 나타나는 특정 미생물 서명(Signature)을 찾아내는 연구에 주력하고 있는 것으로 알려졌습니다.

◇AI와 데이터로 진화하는 마이크로바이옴 의료

한편, 일부 선도 기업들은 단순히 유익균을 찾아내는 수준을 넘어, 인공지능(AI)과 데이터를 결합해 질병 치료 전략을 설계하는 데이터 플랫폼 기업으로 진화하고 있습니다.

대표적인 기업인 미국의 세컨드 게놈(Second Genome)은 자체 개발한 미생물 데이터베이스 'sg-4sight'를 바탕으로 대규모 유전체 데이터를 분석하고 있습니다.

특히 길리어드 사이언스(Gilead Sciences) 등 글로벌 빅파마와 협력하며 염증성 장질환(IBD) 및 간 질환 치료를 위한 신약 후보물질 도출에 속도를 내고 있습니다.

AI 기술로 신약 후보 물질 발굴 기간을 획기적으로 단축하면서 마이크로바이옴 정밀 의료의 표준을 구축하고 있다는 평가가 나옵니다.

또 다른 혁신 기업인 캔버스 바이오사이언스(Kanvas Biosciences)는 AI 알고리즘을 활용해 미생물의 장내 위치를 실시간 시각화하는 기술을 선보였습니다.

이는 신약 개발 과정의 시행착오를 줄이고 임상 성공률을 높이는 핵심 기술로 평가되며, 향후 마이크로바이옴 시장의 판도를 바꿀 중요한 요인으로 주목받고 있습니다.

[ 이기연 연구원 / lee.giyeon@mktv.co.kr ]